Der Aufklärungssatellit Discoverer XVI, der erste mit dem neuen C Prime (C′) Kamerasystem KH-​2 , erreichte am 26.10.1960 keine Umlaufbahn, weil sich beim Erstflug der neuen Raketenkombination Thor-​SLV2 Agena-​B die Oberstufe wegen eines Defekts am Zeitschaltwerk nicht abtrennen ließ. Ursächlich war ein unterbrochener Stromkreis im 28-​Volt Bordsystem. Dennoch sollte sich die Einführung der Agena-​B auch im Hinblick auf die Zuverlässigkeit als großer Fortschritt für das Discoverer Programm erweisen. Neben dem CORONA Fotoaufklärer fiel diesem Fehlstart auch das Transit-​On-​Discoverer (TOD 5) Experiment zum Opfer, mit dem ergänzende Doppler-​Meßdaten für das Transit Navigationssatellitensystem hätten gesammelt werden sollen. Außerdem war auf der Agena eine AFTRACK Nutzlast namens SOCTOP II (auch SOCTOP IIA) integriert gewesen, die als Detektor für die Signale russischer Bahnverfolgungsradare konzipiert war. In US Geheimdienstkreisen gab es nämlich Befürchtungen, daß die Sowjetunion US Aufklärungssatelliten aktiv per Radar verfolgte und Kapazitäten zu ihrem Abschuß aufbaute. Speziell die beiden SOCTOP II Nutzlasten sollten daher nicht nur Signale im S-​Band (2,5 bis 3,2 GHz) registrieren, sondern auch zwischen 300 und 900 MHz, wo man Aktivitäten von ABM Systemen erwartete.