Mit Kosmos 399 setzte die Sowjetunion die Serie ihrer Fotoaufklärungssatelliten vom Typ Zenit-​4 M (Erzeugnis 11F692, Codename „Germes“) fort. Eine Woschod 11A57  Rakete brachte den Satelliten am 03.03.1971 von Baikonur auf eine vorläufige Bahn, die später mit dem Bordtriebwerk noch optimiert werden konnte, um beste Bedingungen für die Gewinnung hochauflösender Aufnahmen sicherzustellen. Nach vierzehn Tagen kehrten diese zusammen mit der Kameraausrüstung in der Landesektion zur Erde zurück.